Protein–RNA interactions for Protein: P46718

Pdcd2, Programmed cell death protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd2P46718 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd2P46718 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd2P46718 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd2P46718 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd2P46718 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd2P46718 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdcd2P46718 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdcd2P46718 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdcd2P46718 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdcd2P46718 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdcd2P46718 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcd2P46718 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcd2P46718 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcd2P46718 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcd2P46718 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcd2P46718 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcd2P46718 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcd2P46718 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcd2P46718 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcd2P46718 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcd2P46718 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcd2P46718 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcd2P46718 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcd2P46718 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcd2P46718 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcd2P46718 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcd2P46718 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcd2P46718 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcd2P46718 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcd2P46718 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd2P46718 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd2P46718 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd2P46718 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd2P46718 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd2P46718 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd2P46718 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcd2P46718 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcd2P46718 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcd2P46718 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcd2P46718 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdcd2P46718 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcd2P46718 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcd2P46718 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcd2P46718 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcd2P46718 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcd2P46718 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcd2P46718 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd2P46718 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd2P46718 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd2P46718 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd2P46718 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd2P46718 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd2P46718 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd2P46718 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd2P46718 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd2P46718 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd2P46718 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd2P46718 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd2P46718 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd2P46718 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd2P46718 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd2P46718 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd2P46718 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd2P46718 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcd2P46718 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcd2P46718 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcd2P46718 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcd2P46718 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcd2P46718 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcd2P46718 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcd2P46718 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcd2P46718 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd2P46718 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd2P46718 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd2P46718 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd2P46718 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd2P46718 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd2P46718 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd2P46718 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd2P46718 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd2P46718 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd2P46718 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd2P46718 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd2P46718 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd2P46718 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd2P46718 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd2P46718 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd2P46718 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd2P46718 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd2P46718 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd2P46718 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd2P46718 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd2P46718 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd2P46718 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd2P46718 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd2P46718 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd2P46718 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd2P46718 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Pdcd2P46718 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd2P46718 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms