Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RECQLP46063 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RECQLP46063 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RECQLP46063 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RECQLP46063 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RECQLP46063 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RECQLP46063 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RECQLP46063 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RECQLP46063 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RECQLP46063 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RECQLP46063 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RECQLP46063 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RECQLP46063 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RECQLP46063 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RECQLP46063 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RECQLP46063 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RECQLP46063 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RECQLP46063 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RECQLP46063 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RECQLP46063 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RECQLP46063 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RECQLP46063 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RECQLP46063 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RECQLP46063 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RECQLP46063 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RECQLP46063 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RECQLP46063 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RECQLP46063 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RECQLP46063 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RECQLP46063 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RECQLP46063 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RECQLP46063 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RECQLP46063 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RECQLP46063 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RECQLP46063 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RECQLP46063 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RECQLP46063 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RECQLP46063 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RECQLP46063 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RECQLP46063 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RECQLP46063 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RECQLP46063 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RECQLP46063 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RECQLP46063 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RECQLP46063 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RECQLP46063 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RECQLP46063 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RECQLP46063 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RECQLP46063 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RECQLP46063 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RECQLP46063 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RECQLP46063 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RECQLP46063 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RECQLP46063 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RECQLP46063 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RECQLP46063 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RECQLP46063 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RECQLP46063 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RECQLP46063 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RECQLP46063 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RECQLP46063 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RECQLP46063 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RECQLP46063 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RECQLP46063 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RECQLP46063 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RECQLP46063 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RECQLP46063 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RECQLP46063 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RECQLP46063 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RECQLP46063 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RECQLP46063 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RECQLP46063 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RECQLP46063 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RECQLP46063 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RECQLP46063 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RECQLP46063 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RECQLP46063 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RECQLP46063 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RECQLP46063 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RECQLP46063 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RECQLP46063 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RECQLP46063 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RECQLP46063 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RECQLP46063 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RECQLP46063 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RECQLP46063 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RECQLP46063 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RECQLP46063 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RECQLP46063 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RECQLP46063 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RECQLP46063 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RECQLP46063 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RECQLP46063 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RECQLP46063 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RECQLP46063 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RECQLP46063 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RECQLP46063 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RECQLP46063 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RECQLP46063 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RECQLP46063 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 401.5 ms