Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSFMP43897 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSFMP43897 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSFMP43897 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSFMP43897 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSFMP43897 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSFMP43897 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSFMP43897 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSFMP43897 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSFMP43897 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSFMP43897 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSFMP43897 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSFMP43897 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSFMP43897 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TSFMP43897 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSFMP43897 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSFMP43897 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSFMP43897 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSFMP43897 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSFMP43897 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSFMP43897 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSFMP43897 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSFMP43897 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSFMP43897 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSFMP43897 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSFMP43897 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSFMP43897 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSFMP43897 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSFMP43897 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSFMP43897 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSFMP43897 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSFMP43897 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSFMP43897 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TSFMP43897 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSFMP43897 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSFMP43897 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSFMP43897 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSFMP43897 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSFMP43897 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSFMP43897 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSFMP43897 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSFMP43897 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSFMP43897 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSFMP43897 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSFMP43897 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSFMP43897 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSFMP43897 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSFMP43897 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSFMP43897 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSFMP43897 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSFMP43897 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSFMP43897 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TSFMP43897 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSFMP43897 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSFMP43897 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TSFMP43897 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSFMP43897 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSFMP43897 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSFMP43897 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSFMP43897 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSFMP43897 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSFMP43897 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSFMP43897 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSFMP43897 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSFMP43897 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSFMP43897 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSFMP43897 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSFMP43897 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSFMP43897 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSFMP43897 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSFMP43897 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSFMP43897 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSFMP43897 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSFMP43897 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSFMP43897 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TSFMP43897 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSFMP43897 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSFMP43897 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TSFMP43897 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSFMP43897 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSFMP43897 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSFMP43897 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSFMP43897 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSFMP43897 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSFMP43897 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSFMP43897 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSFMP43897 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSFMP43897 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSFMP43897 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSFMP43897 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSFMP43897 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSFMP43897 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSFMP43897 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSFMP43897 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSFMP43897 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSFMP43897 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSFMP43897 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSFMP43897 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSFMP43897 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TSFMP43897 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.7 ms