Protein–RNA interactions for Protein: P43487

RANBP1, Ran-specific GTPase-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP1P43487 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RANBP1P43487 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms