Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
MCAMP43121 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
MCAMP43121 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
MCAMP43121 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MCAMP43121 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MCAMP43121 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
MCAMP43121 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
MCAMP43121 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MCAMP43121 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MCAMP43121 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
MCAMP43121 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MCAMP43121 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MCAMP43121 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MCAMP43121 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MCAMP43121 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MCAMP43121 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
MCAMP43121 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
MCAMP43121 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MCAMP43121 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MCAMP43121 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MCAMP43121 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MCAMP43121 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MCAMP43121 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
MCAMP43121 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MCAMP43121 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MCAMP43121 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MCAMP43121 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MCAMP43121 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
MCAMP43121 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MCAMP43121 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MCAMP43121 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MCAMP43121 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MCAMP43121 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MCAMP43121 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MCAMP43121 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MCAMP43121 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MCAMP43121 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MCAMP43121 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MCAMP43121 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MCAMP43121 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MCAMP43121 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MCAMP43121 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MCAMP43121 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MCAMP43121 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MCAMP43121 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MCAMP43121 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MCAMP43121 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MCAMP43121 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MCAMP43121 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MCAMP43121 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
MCAMP43121 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MCAMP43121 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MCAMP43121 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MCAMP43121 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MCAMP43121 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MCAMP43121 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MCAMP43121 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
MCAMP43121 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
MCAMP43121 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MCAMP43121 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MCAMP43121 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MCAMP43121 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MCAMP43121 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MCAMP43121 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MCAMP43121 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MCAMP43121 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
MCAMP43121 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MCAMP43121 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MCAMP43121 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MCAMP43121 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MCAMP43121 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
MCAMP43121 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MCAMP43121 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MCAMP43121 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MCAMP43121 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MCAMP43121 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MCAMP43121 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MCAMP43121 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
MCAMP43121 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MCAMP43121 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MCAMP43121 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
MCAMP43121 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
MCAMP43121 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MCAMP43121 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MCAMP43121 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MCAMP43121 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MCAMP43121 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
MCAMP43121 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MCAMP43121 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MCAMP43121 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MCAMP43121 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MCAMP43121 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MCAMP43121 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MCAMP43121 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MCAMP43121 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MCAMP43121 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MCAMP43121 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MCAMP43121 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MCAMP43121 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MCAMP43121 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms