Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGIRP43119 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGIRP43119 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGIRP43119 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGIRP43119 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGIRP43119 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGIRP43119 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGIRP43119 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGIRP43119 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGIRP43119 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGIRP43119 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGIRP43119 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGIRP43119 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGIRP43119 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTGIRP43119 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGIRP43119 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGIRP43119 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGIRP43119 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGIRP43119 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGIRP43119 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGIRP43119 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGIRP43119 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGIRP43119 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGIRP43119 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGIRP43119 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGIRP43119 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGIRP43119 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGIRP43119 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGIRP43119 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGIRP43119 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGIRP43119 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGIRP43119 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGIRP43119 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGIRP43119 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGIRP43119 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGIRP43119 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGIRP43119 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGIRP43119 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGIRP43119 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGIRP43119 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGIRP43119 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGIRP43119 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGIRP43119 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGIRP43119 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGIRP43119 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGIRP43119 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGIRP43119 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGIRP43119 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGIRP43119 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGIRP43119 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGIRP43119 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGIRP43119 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGIRP43119 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGIRP43119 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGIRP43119 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGIRP43119 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGIRP43119 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGIRP43119 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGIRP43119 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGIRP43119 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGIRP43119 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGIRP43119 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGIRP43119 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGIRP43119 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms