Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC1A2P43004 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC1A2P43004 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC1A2P43004 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC1A2P43004 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC1A2P43004 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A2P43004 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A2P43004 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A2P43004 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A2P43004 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A2P43004 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A2P43004 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A2P43004 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A2P43004 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC1A2P43004 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC1A2P43004 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC1A2P43004 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC1A2P43004 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A2P43004 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A2P43004 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A2P43004 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A2P43004 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A2P43004 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A2P43004 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A2P43004 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A2P43004 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A2P43004 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A2P43004 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A2P43004 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A2P43004 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A2P43004 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A2P43004 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms