Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC44.73■■■■■ 4.75
NCAPD3P42695 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.73■■■■■ 4.75
NCAPD3P42695 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
NCAPD3P42695 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
NCAPD3P42695 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC44.72■■■■■ 4.75
NCAPD3P42695 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
NCAPD3P42695 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.71■■■■■ 4.75
NCAPD3P42695 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC44.7■■■■■ 4.75
NCAPD3P42695 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
NCAPD3P42695 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
NCAPD3P42695 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.67■■■■■ 4.74
NCAPD3P42695 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
NCAPD3P42695 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.66■■■■■ 4.74
NCAPD3P42695 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC44.66■■■■■ 4.74
NCAPD3P42695 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
NCAPD3P42695 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC44.66■■■■■ 4.74
NCAPD3P42695 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.66■■■■■ 4.74
NCAPD3P42695 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
NCAPD3P42695 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.65■■■■■ 4.74
NCAPD3P42695 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC44.65■■■■■ 4.74
NCAPD3P42695 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
NCAPD3P42695 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC44.64■■■■■ 4.74
NCAPD3P42695 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC44.63■■■■■ 4.74
NCAPD3P42695 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
NCAPD3P42695 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC44.62■■■■■ 4.73
NCAPD3P42695 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC44.61■■■■■ 4.73
NCAPD3P42695 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
NCAPD3P42695 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
NCAPD3P42695 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
NCAPD3P42695 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC44.6■■■■■ 4.73
NCAPD3P42695 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC44.6■■■■■ 4.73
NCAPD3P42695 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
NCAPD3P42695 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
NCAPD3P42695 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC44.59■■■■■ 4.73
NCAPD3P42695 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC44.59■■■■■ 4.73
NCAPD3P42695 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
NCAPD3P42695 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
NCAPD3P42695 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC44.59■■■■■ 4.73
NCAPD3P42695 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
NCAPD3P42695 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC44.58■■■■■ 4.73
NCAPD3P42695 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
NCAPD3P42695 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC44.58■■■■■ 4.73
NCAPD3P42695 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC44.57■■■■■ 4.73
NCAPD3P42695 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC44.57■■■■■ 4.73
NCAPD3P42695 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
NCAPD3P42695 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.72
NCAPD3P42695 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
NCAPD3P42695 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
NCAPD3P42695 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC44.55■■■■■ 4.72
NCAPD3P42695 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
NCAPD3P42695 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC44.53■■■■■ 4.72
NCAPD3P42695 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC44.53■■■■■ 4.72
NCAPD3P42695 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
NCAPD3P42695 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
NCAPD3P42695 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC44.53■■■■■ 4.72
NCAPD3P42695 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC44.52■■■■■ 4.72
NCAPD3P42695 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
NCAPD3P42695 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
NCAPD3P42695 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.51■■■■■ 4.72
NCAPD3P42695 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
NCAPD3P42695 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
NCAPD3P42695 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
NCAPD3P42695 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
NCAPD3P42695 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC44.5■■■■■ 4.71
NCAPD3P42695 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC44.49■■■■■ 4.71
NCAPD3P42695 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC44.49■■■■■ 4.71
NCAPD3P42695 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
NCAPD3P42695 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
NCAPD3P42695 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC44.47■■■■■ 4.71
NCAPD3P42695 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC44.47■■■■■ 4.71
NCAPD3P42695 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC44.47■■■■■ 4.71
NCAPD3P42695 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
NCAPD3P42695 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
NCAPD3P42695 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC44.45■■■■■ 4.71
NCAPD3P42695 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.71
NCAPD3P42695 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC44.44■■■■■ 4.71
NCAPD3P42695 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC44.44■■■■■ 4.7
NCAPD3P42695 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
NCAPD3P42695 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.44■■■■■ 4.7
NCAPD3P42695 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC44.42■■■■■ 4.7
NCAPD3P42695 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
NCAPD3P42695 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.42■■■■■ 4.7
NCAPD3P42695 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
NCAPD3P42695 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC44.41■■■■■ 4.7
NCAPD3P42695 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
NCAPD3P42695 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC44.41■■■■■ 4.7
NCAPD3P42695 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.4■■■■■ 4.7
NCAPD3P42695 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC44.4■■■■■ 4.7
NCAPD3P42695 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC44.4■■■■■ 4.7
NCAPD3P42695 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
NCAPD3P42695 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
NCAPD3P42695 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC44.4■■■■■ 4.7
NCAPD3P42695 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC44.4■■■■■ 4.7
NCAPD3P42695 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
NCAPD3P42695 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
NCAPD3P42695 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
NCAPD3P42695 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
NCAPD3P42695 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
NCAPD3P42695 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
NCAPD3P42695 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.38■■■■■ 4.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms