Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIA1P42261 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIA1P42261 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIA1P42261 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms