Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC19A1P41440 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC19A1P41440 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC19A1P41440 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC19A1P41440 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC19A1P41440 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC19A1P41440 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC19A1P41440 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC19A1P41440 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC19A1P41440 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC19A1P41440 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC19A1P41440 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC19A1P41440 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC19A1P41440 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC19A1P41440 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC19A1P41440 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC19A1P41440 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC19A1P41440 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC19A1P41440 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC19A1P41440 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC19A1P41440 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC19A1P41440 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC19A1P41440 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC19A1P41440 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC19A1P41440 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC19A1P41440 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC19A1P41440 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC19A1P41440 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC19A1P41440 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC19A1P41440 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC19A1P41440 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC19A1P41440 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC19A1P41440 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC19A1P41440 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC19A1P41440 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC19A1P41440 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC19A1P41440 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC19A1P41440 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC19A1P41440 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC19A1P41440 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC19A1P41440 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC19A1P41440 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC19A1P41440 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC19A1P41440 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC19A1P41440 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC19A1P41440 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC19A1P41440 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC19A1P41440 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC19A1P41440 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC19A1P41440 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC19A1P41440 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC19A1P41440 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC19A1P41440 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC19A1P41440 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC19A1P41440 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC19A1P41440 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC19A1P41440 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC19A1P41440 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC19A1P41440 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC19A1P41440 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC19A1P41440 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC19A1P41440 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms