Protein–RNA interactions for Protein: P41218

MNDA, Myeloid cell nuclear differentiation antigen, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNDAP41218 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MNDAP41218 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MNDAP41218 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MNDAP41218 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MNDAP41218 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MNDAP41218 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MNDAP41218 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MNDAP41218 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MNDAP41218 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MNDAP41218 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MNDAP41218 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MNDAP41218 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MNDAP41218 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MNDAP41218 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MNDAP41218 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MNDAP41218 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MNDAP41218 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MNDAP41218 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MNDAP41218 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MNDAP41218 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MNDAP41218 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MNDAP41218 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MNDAP41218 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MNDAP41218 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MNDAP41218 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MNDAP41218 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MNDAP41218 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MNDAP41218 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MNDAP41218 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MNDAP41218 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MNDAP41218 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MNDAP41218 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MNDAP41218 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MNDAP41218 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MNDAP41218 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MNDAP41218 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MNDAP41218 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MNDAP41218 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MNDAP41218 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MNDAP41218 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MNDAP41218 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MNDAP41218 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MNDAP41218 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MNDAP41218 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MNDAP41218 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MNDAP41218 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MNDAP41218 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MNDAP41218 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MNDAP41218 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MNDAP41218 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MNDAP41218 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MNDAP41218 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MNDAP41218 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MNDAP41218 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MNDAP41218 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MNDAP41218 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MNDAP41218 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MNDAP41218 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MNDAP41218 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MNDAP41218 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MNDAP41218 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MNDAP41218 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MNDAP41218 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MNDAP41218 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MNDAP41218 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MNDAP41218 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MNDAP41218 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MNDAP41218 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MNDAP41218 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MNDAP41218 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MNDAP41218 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MNDAP41218 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MNDAP41218 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MNDAP41218 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MNDAP41218 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MNDAP41218 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MNDAP41218 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MNDAP41218 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MNDAP41218 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MNDAP41218 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MNDAP41218 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MNDAP41218 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MNDAP41218 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MNDAP41218 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MNDAP41218 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MNDAP41218 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MNDAP41218 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MNDAP41218 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MNDAP41218 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MNDAP41218 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MNDAP41218 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MNDAP41218 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MNDAP41218 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MNDAP41218 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MNDAP41218 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MNDAP41218 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MNDAP41218 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MNDAP41218 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MNDAP41218 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MNDAP41218 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms