Protein–RNA interactions for Protein: P40337

VHL, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLP40337 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VHLP40337 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VHLP40337 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VHLP40337 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VHLP40337 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VHLP40337 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VHLP40337 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VHLP40337 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VHLP40337 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VHLP40337 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VHLP40337 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VHLP40337 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VHLP40337 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VHLP40337 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VHLP40337 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VHLP40337 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VHLP40337 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VHLP40337 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VHLP40337 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VHLP40337 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VHLP40337 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VHLP40337 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VHLP40337 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VHLP40337 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VHLP40337 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VHLP40337 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VHLP40337 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VHLP40337 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VHLP40337 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VHLP40337 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VHLP40337 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VHLP40337 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VHLP40337 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VHLP40337 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VHLP40337 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VHLP40337 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VHLP40337 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VHLP40337 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VHLP40337 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VHLP40337 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VHLP40337 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VHLP40337 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VHLP40337 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VHLP40337 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VHLP40337 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VHLP40337 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VHLP40337 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VHLP40337 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VHLP40337 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VHLP40337 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VHLP40337 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VHLP40337 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VHLP40337 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VHLP40337 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VHLP40337 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VHLP40337 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VHLP40337 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VHLP40337 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VHLP40337 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VHLP40337 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VHLP40337 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VHLP40337 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VHLP40337 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VHLP40337 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VHLP40337 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VHLP40337 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VHLP40337 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VHLP40337 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VHLP40337 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VHLP40337 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VHLP40337 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VHLP40337 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VHLP40337 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VHLP40337 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VHLP40337 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VHLP40337 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VHLP40337 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VHLP40337 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VHLP40337 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VHLP40337 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VHLP40337 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VHLP40337 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VHLP40337 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VHLP40337 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VHLP40337 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VHLP40337 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VHLP40337 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VHLP40337 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VHLP40337 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VHLP40337 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VHLP40337 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VHLP40337 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VHLP40337 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VHLP40337 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VHLP40337 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VHLP40337 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VHLP40337 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VHLP40337 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VHLP40337 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VHLP40337 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms