Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTRLP40313 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTRLP40313 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTRLP40313 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTRLP40313 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTRLP40313 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTRLP40313 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTRLP40313 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTRLP40313 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTRLP40313 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTRLP40313 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTRLP40313 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTRLP40313 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTRLP40313 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTRLP40313 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTRLP40313 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTRLP40313 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTRLP40313 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTRLP40313 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTRLP40313 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTRLP40313 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTRLP40313 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTRLP40313 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CTRLP40313 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTRLP40313 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTRLP40313 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTRLP40313 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTRLP40313 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTRLP40313 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTRLP40313 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTRLP40313 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTRLP40313 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTRLP40313 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTRLP40313 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTRLP40313 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTRLP40313 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTRLP40313 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTRLP40313 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTRLP40313 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTRLP40313 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTRLP40313 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTRLP40313 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTRLP40313 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTRLP40313 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTRLP40313 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTRLP40313 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTRLP40313 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTRLP40313 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTRLP40313 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTRLP40313 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTRLP40313 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTRLP40313 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTRLP40313 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTRLP40313 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTRLP40313 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTRLP40313 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTRLP40313 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTRLP40313 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTRLP40313 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTRLP40313 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTRLP40313 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTRLP40313 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTRLP40313 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTRLP40313 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTRLP40313 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTRLP40313 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTRLP40313 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTRLP40313 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTRLP40313 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTRLP40313 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTRLP40313 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTRLP40313 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTRLP40313 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTRLP40313 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTRLP40313 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTRLP40313 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTRLP40313 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTRLP40313 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTRLP40313 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTRLP40313 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTRLP40313 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTRLP40313 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTRLP40313 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTRLP40313 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTRLP40313 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTRLP40313 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTRLP40313 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTRLP40313 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTRLP40313 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTRLP40313 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTRLP40313 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTRLP40313 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTRLP40313 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTRLP40313 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTRLP40313 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTRLP40313 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTRLP40313 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTRLP40313 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTRLP40313 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTRLP40313 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms