Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Chd1P40201 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Chd1P40201 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Chd1P40201 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Chd1P40201 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Chd1P40201 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Chd1P40201 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Chd1P40201 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Chd1P40201 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Chd1P40201 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Chd1P40201 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Chd1P40201 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
Chd1P40201 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Chd1P40201 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
Chd1P40201 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Chd1P40201 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Chd1P40201 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Chd1P40201 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Chd1P40201 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Chd1P40201 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Chd1P40201 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Chd1P40201 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Chd1P40201 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Chd1P40201 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Chd1P40201 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Chd1P40201 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Chd1P40201 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Chd1P40201 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Chd1P40201 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Chd1P40201 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Chd1P40201 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Chd1P40201 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
Chd1P40201 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Chd1P40201 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Chd1P40201 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Chd1P40201 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Chd1P40201 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Chd1P40201 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Chd1P40201 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Chd1P40201 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Chd1P40201 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Chd1P40201 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Chd1P40201 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Chd1P40201 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Chd1P40201 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Chd1P40201 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Chd1P40201 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Chd1P40201 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Chd1P40201 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Chd1P40201 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Chd1P40201 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Chd1P40201 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Chd1P40201 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Chd1P40201 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Chd1P40201 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Chd1P40201 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Chd1P40201 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Chd1P40201 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Chd1P40201 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Chd1P40201 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Chd1P40201 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Chd1P40201 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Chd1P40201 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Chd1P40201 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Chd1P40201 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Chd1P40201 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Chd1P40201 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Chd1P40201 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Chd1P40201 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Chd1P40201 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Chd1P40201 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Chd1P40201 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Chd1P40201 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Chd1P40201 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Chd1P40201 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Chd1P40201 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Chd1P40201 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Chd1P40201 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Chd1P40201 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Chd1P40201 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Chd1P40201 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Chd1P40201 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Chd1P40201 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Chd1P40201 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Chd1P40201 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Chd1P40201 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Chd1P40201 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Chd1P40201 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Chd1P40201 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Chd1P40201 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Chd1P40201 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Chd1P40201 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Chd1P40201 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Chd1P40201 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Chd1P40201 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Chd1P40201 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Chd1P40201 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Chd1P40201 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Chd1P40201 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Chd1P40201 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms