Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PtprkP35822 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PtprkP35822 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PtprkP35822 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PtprkP35822 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PtprkP35822 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
PtprkP35822 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
PtprkP35822 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
PtprkP35822 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PtprkP35822 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PtprkP35822 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PtprkP35822 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PtprkP35822 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
PtprkP35822 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PtprkP35822 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PtprkP35822 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PtprkP35822 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PtprkP35822 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PtprkP35822 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PtprkP35822 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PtprkP35822 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PtprkP35822 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PtprkP35822 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PtprkP35822 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PtprkP35822 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
PtprkP35822 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PtprkP35822 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PtprkP35822 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PtprkP35822 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PtprkP35822 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
PtprkP35822 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PtprkP35822 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PtprkP35822 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PtprkP35822 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PtprkP35822 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PtprkP35822 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PtprkP35822 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
PtprkP35822 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PtprkP35822 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PtprkP35822 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PtprkP35822 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PtprkP35822 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PtprkP35822 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PtprkP35822 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PtprkP35822 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PtprkP35822 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PtprkP35822 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PtprkP35822 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PtprkP35822 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
PtprkP35822 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
PtprkP35822 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PtprkP35822 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PtprkP35822 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PtprkP35822 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
PtprkP35822 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PtprkP35822 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PtprkP35822 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PtprkP35822 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PtprkP35822 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PtprkP35822 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PtprkP35822 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PtprkP35822 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PtprkP35822 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PtprkP35822 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PtprkP35822 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PtprkP35822 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PtprkP35822 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PtprkP35822 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PtprkP35822 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PtprkP35822 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PtprkP35822 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PtprkP35822 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PtprkP35822 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
PtprkP35822 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PtprkP35822 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
PtprkP35822 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PtprkP35822 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PtprkP35822 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PtprkP35822 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
PtprkP35822 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PtprkP35822 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PtprkP35822 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PtprkP35822 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PtprkP35822 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PtprkP35822 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PtprkP35822 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PtprkP35822 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PtprkP35822 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PtprkP35822 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PtprkP35822 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PtprkP35822 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PtprkP35822 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PtprkP35822 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PtprkP35822 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PtprkP35822 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PtprkP35822 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PtprkP35822 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PtprkP35822 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PtprkP35822 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PtprkP35822 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms