Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Grin2aP35436 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Grin2aP35436 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Grin2aP35436 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Grin2aP35436 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Grin2aP35436 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Grin2aP35436 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Grin2aP35436 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Grin2aP35436 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Grin2aP35436 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Grin2aP35436 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Grin2aP35436 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Grin2aP35436 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Grin2aP35436 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Grin2aP35436 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Grin2aP35436 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Grin2aP35436 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Grin2aP35436 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Grin2aP35436 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Grin2aP35436 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Grin2aP35436 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Grin2aP35436 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Grin2aP35436 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Grin2aP35436 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Grin2aP35436 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Grin2aP35436 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
Grin2aP35436 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Grin2aP35436 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Grin2aP35436 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Grin2aP35436 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Grin2aP35436 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Grin2aP35436 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Grin2aP35436 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Grin2aP35436 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Grin2aP35436 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Grin2aP35436 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Grin2aP35436 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Grin2aP35436 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Grin2aP35436 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Grin2aP35436 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Grin2aP35436 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Grin2aP35436 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Grin2aP35436 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Grin2aP35436 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Grin2aP35436 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Grin2aP35436 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Grin2aP35436 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Grin2aP35436 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Grin2aP35436 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Grin2aP35436 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Grin2aP35436 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Grin2aP35436 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Grin2aP35436 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Grin2aP35436 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Grin2aP35436 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Grin2aP35436 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Grin2aP35436 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Grin2aP35436 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Grin2aP35436 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Grin2aP35436 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Grin2aP35436 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Grin2aP35436 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Grin2aP35436 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Grin2aP35436 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Grin2aP35436 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Grin2aP35436 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Grin2aP35436 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Grin2aP35436 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Grin2aP35436 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Grin2aP35436 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Grin2aP35436 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Grin2aP35436 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Grin2aP35436 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Grin2aP35436 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Grin2aP35436 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.37
Grin2aP35436 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Grin2aP35436 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.37
Grin2aP35436 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Grin2aP35436 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Grin2aP35436 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Grin2aP35436 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Grin2aP35436 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Grin2aP35436 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Grin2aP35436 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Grin2aP35436 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Grin2aP35436 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Grin2aP35436 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Grin2aP35436 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
Grin2aP35436 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Grin2aP35436 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Grin2aP35436 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Grin2aP35436 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Grin2aP35436 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
Grin2aP35436 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Grin2aP35436 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Grin2aP35436 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Grin2aP35436 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Grin2aP35436 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Grin2aP35436 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Grin2aP35436 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms