Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCKBRP32239 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCKBRP32239 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCKBRP32239 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCKBRP32239 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCKBRP32239 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCKBRP32239 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCKBRP32239 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCKBRP32239 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCKBRP32239 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCKBRP32239 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCKBRP32239 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCKBRP32239 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCKBRP32239 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCKBRP32239 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCKBRP32239 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCKBRP32239 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCKBRP32239 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCKBRP32239 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCKBRP32239 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCKBRP32239 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCKBRP32239 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCKBRP32239 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCKBRP32239 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCKBRP32239 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCKBRP32239 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCKBRP32239 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCKBRP32239 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCKBRP32239 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCKBRP32239 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCKBRP32239 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCKBRP32239 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCKBRP32239 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCKBRP32239 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms