Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SsbP32067 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SsbP32067 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SsbP32067 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SsbP32067 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SsbP32067 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SsbP32067 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SsbP32067 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SsbP32067 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SsbP32067 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SsbP32067 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SsbP32067 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SsbP32067 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SsbP32067 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SsbP32067 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SsbP32067 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SsbP32067 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SsbP32067 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SsbP32067 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SsbP32067 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SsbP32067 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SsbP32067 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SsbP32067 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SsbP32067 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SsbP32067 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SsbP32067 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SsbP32067 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SsbP32067 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SsbP32067 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SsbP32067 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SsbP32067 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SsbP32067 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SsbP32067 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SsbP32067 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SsbP32067 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SsbP32067 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SsbP32067 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SsbP32067 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SsbP32067 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SsbP32067 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SsbP32067 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SsbP32067 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SsbP32067 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SsbP32067 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SsbP32067 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SsbP32067 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SsbP32067 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SsbP32067 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SsbP32067 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SsbP32067 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SsbP32067 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SsbP32067 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SsbP32067 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SsbP32067 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SsbP32067 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SsbP32067 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SsbP32067 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SsbP32067 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SsbP32067 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SsbP32067 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SsbP32067 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SsbP32067 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SsbP32067 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SsbP32067 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SsbP32067 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SsbP32067 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SsbP32067 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SsbP32067 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SsbP32067 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SsbP32067 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SsbP32067 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SsbP32067 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SsbP32067 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SsbP32067 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SsbP32067 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SsbP32067 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SsbP32067 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SsbP32067 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SsbP32067 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SsbP32067 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SsbP32067 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SsbP32067 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SsbP32067 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SsbP32067 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SsbP32067 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SsbP32067 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SsbP32067 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SsbP32067 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SsbP32067 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SsbP32067 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SsbP32067 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SsbP32067 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SsbP32067 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SsbP32067 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SsbP32067 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SsbP32067 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SsbP32067 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SsbP32067 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SsbP32067 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SsbP32067 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms