Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CASQ1P31415 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASQ1P31415 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASQ1P31415 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CASQ1P31415 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CASQ1P31415 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASQ1P31415 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASQ1P31415 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CASQ1P31415 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASQ1P31415 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASQ1P31415 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASQ1P31415 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASQ1P31415 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASQ1P31415 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASQ1P31415 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASQ1P31415 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASQ1P31415 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASQ1P31415 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASQ1P31415 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASQ1P31415 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASQ1P31415 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASQ1P31415 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASQ1P31415 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CASQ1P31415 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASQ1P31415 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.8 ms