Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxa10P31310 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hoxa10P31310 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxa10P31310 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxa10P31310 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms