Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa2P31245 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa2P31245 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa2P31245 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa2P31245 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa2P31245 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa2P31245 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxa2P31245 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxa2P31245 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxa2P31245 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxa2P31245 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxa2P31245 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxa2P31245 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxa2P31245 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa2P31245 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa2P31245 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa2P31245 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa2P31245 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa2P31245 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa2P31245 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa2P31245 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa2P31245 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa2P31245 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa2P31245 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa2P31245 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa2P31245 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa2P31245 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa2P31245 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa2P31245 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa2P31245 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa2P31245 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa2P31245 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa2P31245 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa2P31245 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa2P31245 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa2P31245 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa2P31245 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa2P31245 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa2P31245 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa2P31245 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa2P31245 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa2P31245 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa2P31245 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa2P31245 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa2P31245 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms