Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msr1P30204 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msr1P30204 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msr1P30204 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msr1P30204 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msr1P30204 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Msr1P30204 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Msr1P30204 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msr1P30204 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msr1P30204 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msr1P30204 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msr1P30204 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msr1P30204 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msr1P30204 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msr1P30204 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msr1P30204 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msr1P30204 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msr1P30204 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msr1P30204 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msr1P30204 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msr1P30204 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msr1P30204 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Msr1P30204 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msr1P30204 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msr1P30204 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msr1P30204 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msr1P30204 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msr1P30204 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msr1P30204 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msr1P30204 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msr1P30204 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Msr1P30204 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msr1P30204 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msr1P30204 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Msr1P30204 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Msr1P30204 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Msr1P30204 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Msr1P30204 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Msr1P30204 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msr1P30204 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Msr1P30204 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Msr1P30204 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Msr1P30204 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Msr1P30204 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msr1P30204 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msr1P30204 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msr1P30204 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msr1P30204 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msr1P30204 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msr1P30204 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Msr1P30204 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msr1P30204 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msr1P30204 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msr1P30204 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msr1P30204 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msr1P30204 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msr1P30204 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msr1P30204 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Msr1P30204 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msr1P30204 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Msr1P30204 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msr1P30204 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msr1P30204 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msr1P30204 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.5 ms