Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2E2P29084 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2E2P29084 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2E2P29084 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2E2P29084 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2E2P29084 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2E2P29084 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2E2P29084 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2E2P29084 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2E2P29084 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2E2P29084 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2E2P29084 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2E2P29084 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2E2P29084 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2E2P29084 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2E2P29084 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E2P29084 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2E2P29084 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms