Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcdP28867 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcdP28867 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PrkcdP28867 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PrkcdP28867 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkcdP28867 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PrkcdP28867 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PrkcdP28867 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcdP28867 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcdP28867 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcdP28867 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcdP28867 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcdP28867 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcdP28867 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcdP28867 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcdP28867 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcdP28867 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcdP28867 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcdP28867 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkcdP28867 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkcdP28867 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkcdP28867 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkcdP28867 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkcdP28867 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkcdP28867 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkcdP28867 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkcdP28867 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkcdP28867 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkcdP28867 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkcdP28867 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkcdP28867 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkcdP28867 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkcdP28867 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkcdP28867 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkcdP28867 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcdP28867 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcdP28867 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcdP28867 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcdP28867 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PrkcdP28867 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PrkcdP28867 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkcdP28867 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkcdP28867 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkcdP28867 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkcdP28867 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkcdP28867 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkcdP28867 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkcdP28867 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkcdP28867 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkcdP28867 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcdP28867 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcdP28867 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcdP28867 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcdP28867 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcdP28867 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcdP28867 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkcdP28867 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkcdP28867 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkcdP28867 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
PrkcdP28867 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkcdP28867 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkcdP28867 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkcdP28867 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkcdP28867 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkcdP28867 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkcdP28867 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkcdP28867 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms