Protein–RNA interactions for Protein: P28575

Ipp, Actin-binding protein IPP, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IppP28575 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IppP28575 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IppP28575 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IppP28575 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IppP28575 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IppP28575 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IppP28575 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IppP28575 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IppP28575 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IppP28575 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IppP28575 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IppP28575 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IppP28575 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IppP28575 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IppP28575 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IppP28575 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IppP28575 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IppP28575 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IppP28575 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IppP28575 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IppP28575 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IppP28575 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IppP28575 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IppP28575 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IppP28575 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IppP28575 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IppP28575 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IppP28575 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IppP28575 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IppP28575 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IppP28575 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IppP28575 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IppP28575 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IppP28575 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IppP28575 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IppP28575 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IppP28575 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IppP28575 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IppP28575 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IppP28575 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IppP28575 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IppP28575 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IppP28575 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IppP28575 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IppP28575 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IppP28575 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IppP28575 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IppP28575 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IppP28575 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IppP28575 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IppP28575 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IppP28575 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IppP28575 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IppP28575 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IppP28575 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IppP28575 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IppP28575 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IppP28575 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IppP28575 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IppP28575 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IppP28575 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IppP28575 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IppP28575 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IppP28575 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IppP28575 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IppP28575 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IppP28575 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IppP28575 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IppP28575 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IppP28575 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IppP28575 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IppP28575 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IppP28575 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IppP28575 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IppP28575 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IppP28575 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IppP28575 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IppP28575 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IppP28575 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IppP28575 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IppP28575 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IppP28575 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IppP28575 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IppP28575 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IppP28575 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IppP28575 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IppP28575 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IppP28575 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IppP28575 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
IppP28575 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IppP28575 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IppP28575 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IppP28575 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IppP28575 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IppP28575 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IppP28575 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IppP28575 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IppP28575 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
IppP28575 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IppP28575 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 254.4 ms