Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALRP27797 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CALRP27797 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CALRP27797 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALRP27797 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALRP27797 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALRP27797 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CALRP27797 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALRP27797 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALRP27797 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALRP27797 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALRP27797 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALRP27797 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALRP27797 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALRP27797 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALRP27797 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALRP27797 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALRP27797 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALRP27797 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALRP27797 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALRP27797 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALRP27797 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CALRP27797 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALRP27797 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALRP27797 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALRP27797 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALRP27797 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALRP27797 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALRP27797 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALRP27797 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALRP27797 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALRP27797 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALRP27797 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALRP27797 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALRP27797 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALRP27797 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALRP27797 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALRP27797 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALRP27797 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALRP27797 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALRP27797 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALRP27797 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALRP27797 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALRP27797 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALRP27797 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALRP27797 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALRP27797 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALRP27797 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALRP27797 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALRP27797 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALRP27797 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALRP27797 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALRP27797 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALRP27797 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALRP27797 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALRP27797 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALRP27797 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALRP27797 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALRP27797 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALRP27797 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALRP27797 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALRP27797 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALRP27797 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALRP27797 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CALRP27797 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CALRP27797 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CALRP27797 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALRP27797 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALRP27797 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALRP27797 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALRP27797 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALRP27797 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALRP27797 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALRP27797 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALRP27797 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALRP27797 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALRP27797 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALRP27797 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALRP27797 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALRP27797 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALRP27797 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALRP27797 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALRP27797 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALRP27797 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALRP27797 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALRP27797 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALRP27797 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALRP27797 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALRP27797 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALRP27797 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALRP27797 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALRP27797 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALRP27797 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALRP27797 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALRP27797 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALRP27797 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALRP27797 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALRP27797 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALRP27797 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALRP27797 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms