Protein–RNA interactions for Protein: P27708

CAD, CAD protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADP27708 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CADP27708 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CADP27708 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CADP27708 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CADP27708 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CADP27708 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CADP27708 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CADP27708 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CADP27708 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CADP27708 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CADP27708 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CADP27708 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CADP27708 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CADP27708 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CADP27708 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CADP27708 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CADP27708 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CADP27708 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CADP27708 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CADP27708 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CADP27708 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CADP27708 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CADP27708 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CADP27708 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CADP27708 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CADP27708 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CADP27708 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CADP27708 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CADP27708 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CADP27708 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CADP27708 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CADP27708 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CADP27708 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CADP27708 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CADP27708 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CADP27708 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CADP27708 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CADP27708 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CADP27708 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CADP27708 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CADP27708 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CADP27708 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CADP27708 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CADP27708 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CADP27708 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CADP27708 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CADP27708 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CADP27708 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CADP27708 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CADP27708 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CADP27708 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CADP27708 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CADP27708 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CADP27708 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CADP27708 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CADP27708 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CADP27708 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CADP27708 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CADP27708 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CADP27708 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CADP27708 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CADP27708 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CADP27708 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CADP27708 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CADP27708 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CADP27708 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CADP27708 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CADP27708 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CADP27708 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CADP27708 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CADP27708 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CADP27708 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CADP27708 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CADP27708 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CADP27708 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CADP27708 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CADP27708 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CADP27708 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CADP27708 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CADP27708 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CADP27708 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CADP27708 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CADP27708 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CADP27708 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CADP27708 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CADP27708 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CADP27708 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CADP27708 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CADP27708 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CADP27708 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CADP27708 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CADP27708 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CADP27708 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CADP27708 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CADP27708 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CADP27708 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CADP27708 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CADP27708 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CADP27708 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CADP27708 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms