Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd40lgP27548 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd40lgP27548 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd40lgP27548 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd40lgP27548 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd40lgP27548 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd40lgP27548 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd40lgP27548 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd40lgP27548 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd40lgP27548 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd40lgP27548 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd40lgP27548 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd40lgP27548 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd40lgP27548 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd40lgP27548 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd40lgP27548 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd40lgP27548 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd40lgP27548 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd40lgP27548 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd40lgP27548 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd40lgP27548 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd40lgP27548 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd40lgP27548 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd40lgP27548 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd40lgP27548 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd40lgP27548 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd40lgP27548 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd40lgP27548 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd40lgP27548 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd40lgP27548 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd40lgP27548 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd40lgP27548 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd40lgP27548 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd40lgP27548 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd40lgP27548 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd40lgP27548 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd40lgP27548 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd40lgP27548 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd40lgP27548 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd40lgP27548 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd40lgP27548 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd40lgP27548 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd40lgP27548 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd40lgP27548 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd40lgP27548 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd40lgP27548 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd40lgP27548 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd40lgP27548 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd40lgP27548 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd40lgP27548 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd40lgP27548 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd40lgP27548 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd40lgP27548 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms