Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnna1P26231 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnna1P26231 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctnna1P26231 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctnna1P26231 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctnna1P26231 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnna1P26231 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnna1P26231 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnna1P26231 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnna1P26231 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnna1P26231 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnna1P26231 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnna1P26231 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnna1P26231 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnna1P26231 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnna1P26231 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnna1P26231 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnna1P26231 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnna1P26231 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctnna1P26231 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctnna1P26231 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctnna1P26231 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnna1P26231 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnna1P26231 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnna1P26231 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnna1P26231 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnna1P26231 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnna1P26231 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctnna1P26231 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctnna1P26231 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctnna1P26231 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctnna1P26231 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnna1P26231 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnna1P26231 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnna1P26231 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnna1P26231 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnna1P26231 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnna1P26231 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnna1P26231 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnna1P26231 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnna1P26231 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctnna1P26231 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctnna1P26231 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctnna1P26231 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ctnna1P26231 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctnna1P26231 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctnna1P26231 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnna1P26231 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnna1P26231 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnna1P26231 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnna1P26231 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnna1P26231 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnna1P26231 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnna1P26231 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnna1P26231 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctnna1P26231 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnna1P26231 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnna1P26231 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnna1P26231 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnna1P26231 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnna1P26231 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnna1P26231 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnna1P26231 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnna1P26231 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnna1P26231 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnna1P26231 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnna1P26231 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnna1P26231 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnna1P26231 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctnna1P26231 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctnna1P26231 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctnna1P26231 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms