Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnd1P25322 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnd1P25322 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnd1P25322 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnd1P25322 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnd1P25322 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnd1P25322 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnd1P25322 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnd1P25322 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnd1P25322 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnd1P25322 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnd1P25322 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnd1P25322 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnd1P25322 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnd1P25322 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnd1P25322 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnd1P25322 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnd1P25322 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnd1P25322 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnd1P25322 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnd1P25322 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnd1P25322 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnd1P25322 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnd1P25322 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnd1P25322 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnd1P25322 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnd1P25322 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnd1P25322 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccnd1P25322 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccnd1P25322 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccnd1P25322 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccnd1P25322 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccnd1P25322 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccnd1P25322 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccnd1P25322 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccnd1P25322 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccnd1P25322 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccnd1P25322 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccnd1P25322 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccnd1P25322 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccnd1P25322 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccnd1P25322 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccnd1P25322 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccnd1P25322 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccnd1P25322 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccnd1P25322 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.3 ms