Protein–RNA interactions for Protein: P24699

Myf5, Myogenic factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf5P24699 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myf5P24699 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myf5P24699 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myf5P24699 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Myf5P24699 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myf5P24699 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myf5P24699 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myf5P24699 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myf5P24699 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myf5P24699 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myf5P24699 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myf5P24699 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myf5P24699 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Myf5P24699 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Myf5P24699 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myf5P24699 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myf5P24699 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Myf5P24699 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myf5P24699 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myf5P24699 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myf5P24699 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myf5P24699 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myf5P24699 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myf5P24699 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myf5P24699 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myf5P24699 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myf5P24699 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myf5P24699 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myf5P24699 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myf5P24699 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myf5P24699 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myf5P24699 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myf5P24699 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myf5P24699 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myf5P24699 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myf5P24699 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myf5P24699 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myf5P24699 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Myf5P24699 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myf5P24699 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myf5P24699 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myf5P24699 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myf5P24699 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myf5P24699 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myf5P24699 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myf5P24699 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myf5P24699 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Myf5P24699 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myf5P24699 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myf5P24699 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myf5P24699 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myf5P24699 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myf5P24699 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myf5P24699 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Myf5P24699 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myf5P24699 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myf5P24699 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myf5P24699 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myf5P24699 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myf5P24699 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myf5P24699 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myf5P24699 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myf5P24699 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myf5P24699 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myf5P24699 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myf5P24699 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myf5P24699 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myf5P24699 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myf5P24699 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myf5P24699 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myf5P24699 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myf5P24699 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myf5P24699 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myf5P24699 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myf5P24699 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myf5P24699 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Myf5P24699 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Myf5P24699 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Myf5P24699 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Myf5P24699 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Myf5P24699 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Myf5P24699 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Myf5P24699 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Myf5P24699 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Myf5P24699 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Myf5P24699 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Myf5P24699 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Myf5P24699 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Myf5P24699 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myf5P24699 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Myf5P24699 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Myf5P24699 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Myf5P24699 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myf5P24699 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Myf5P24699 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Myf5P24699 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Myf5P24699 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Myf5P24699 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Myf5P24699 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Myf5P24699 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms