Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gria1P23818 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gria1P23818 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gria1P23818 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gria1P23818 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gria1P23818 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gria1P23818 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gria1P23818 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gria1P23818 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gria1P23818 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gria1P23818 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gria1P23818 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gria1P23818 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gria1P23818 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gria1P23818 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gria1P23818 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gria1P23818 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gria1P23818 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gria1P23818 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gria1P23818 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gria1P23818 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gria1P23818 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gria1P23818 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gria1P23818 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gria1P23818 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gria1P23818 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gria1P23818 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gria1P23818 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gria1P23818 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gria1P23818 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gria1P23818 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gria1P23818 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gria1P23818 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gria1P23818 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gria1P23818 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gria1P23818 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gria1P23818 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gria1P23818 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gria1P23818 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gria1P23818 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gria1P23818 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gria1P23818 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gria1P23818 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gria1P23818 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gria1P23818 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gria1P23818 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gria1P23818 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gria1P23818 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gria1P23818 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gria1P23818 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gria1P23818 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gria1P23818 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gria1P23818 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gria1P23818 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gria1P23818 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gria1P23818 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gria1P23818 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gria1P23818 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gria1P23818 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gria1P23818 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gria1P23818 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gria1P23818 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gria1P23818 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gria1P23818 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gria1P23818 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gria1P23818 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gria1P23818 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gria1P23818 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gria1P23818 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gria1P23818 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gria1P23818 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gria1P23818 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gria1P23818 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gria1P23818 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gria1P23818 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gria1P23818 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gria1P23818 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gria1P23818 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gria1P23818 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gria1P23818 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gria1P23818 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gria1P23818 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gria1P23818 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gria1P23818 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gria1P23818 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gria1P23818 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gria1P23818 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gria1P23818 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gria1P23818 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gria1P23818 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gria1P23818 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gria1P23818 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gria1P23818 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gria1P23818 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gria1P23818 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gria1P23818 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gria1P23818 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gria1P23818 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gria1P23818 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gria1P23818 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms