Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Hoxd11P23813 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Hoxd11P23813 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hoxd11P23813 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hoxd11P23813 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxd11P23813 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxd11P23813 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxd11P23813 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxd11P23813 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxd11P23813 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hoxd11P23813 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hoxd11P23813 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hoxd11P23813 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Hoxd11P23813 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hoxd11P23813 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hoxd11P23813 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Hoxd11P23813 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hoxd11P23813 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxd11P23813 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxd11P23813 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxd11P23813 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxd11P23813 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxd11P23813 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxd11P23813 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxd11P23813 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxd11P23813 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxd11P23813 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hoxd11P23813 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hoxd11P23813 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Hoxd11P23813 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Hoxd11P23813 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hoxd11P23813 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hoxd11P23813 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hoxd11P23813 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hoxd11P23813 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hoxd11P23813 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hoxd11P23813 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxd11P23813 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxd11P23813 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxd11P23813 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxd11P23813 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxd11P23813 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxd11P23813 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxd11P23813 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxd11P23813 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxd11P23813 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxd11P23813 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxd11P23813 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxd11P23813 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxd11P23813 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxd11P23813 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxd11P23813 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxd11P23813 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxd11P23813 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxd11P23813 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxd11P23813 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxd11P23813 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxd11P23813 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxd11P23813 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxd11P23813 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxd11P23813 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxd11P23813 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxd11P23813 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxd11P23813 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxd11P23813 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxd11P23813 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxd11P23813 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxd11P23813 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxd11P23813 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxd11P23813 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxd11P23813 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxd11P23813 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hoxd11P23813 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxd11P23813 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxd11P23813 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxd11P23813 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxd11P23813 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxd11P23813 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxd11P23813 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxd11P23813 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxd11P23813 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxd11P23813 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxd11P23813 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxd11P23813 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxd11P23813 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxd11P23813 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxd11P23813 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxd11P23813 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxd11P23813 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxd11P23813 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxd11P23813 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxd11P23813 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxd11P23813 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxd11P23813 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxd11P23813 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxd11P23813 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxd11P23813 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxd11P23813 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxd11P23813 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxd11P23813 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
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