Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRBP23467 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRBP23467 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRBP23467 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRBP23467 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRBP23467 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRBP23467 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRBP23467 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRBP23467 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRBP23467 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRBP23467 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRBP23467 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRBP23467 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRBP23467 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRBP23467 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRBP23467 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRBP23467 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRBP23467 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRBP23467 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRBP23467 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRBP23467 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRBP23467 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRBP23467 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRBP23467 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRBP23467 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRBP23467 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRBP23467 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRBP23467 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRBP23467 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRBP23467 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRBP23467 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRBP23467 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRBP23467 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRBP23467 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRBP23467 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRBP23467 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRBP23467 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRBP23467 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRBP23467 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRBP23467 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRBP23467 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRBP23467 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRBP23467 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRBP23467 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRBP23467 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRBP23467 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRBP23467 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRBP23467 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRBP23467 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRBP23467 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRBP23467 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRBP23467 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRBP23467 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRBP23467 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms