Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XPAP23025 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XPAP23025 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XPAP23025 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XPAP23025 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
XPAP23025 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
XPAP23025 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XPAP23025 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XPAP23025 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XPAP23025 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XPAP23025 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XPAP23025 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
XPAP23025 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XPAP23025 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XPAP23025 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XPAP23025 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XPAP23025 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XPAP23025 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XPAP23025 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XPAP23025 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XPAP23025 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
XPAP23025 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
XPAP23025 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XPAP23025 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XPAP23025 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XPAP23025 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XPAP23025 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XPAP23025 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XPAP23025 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XPAP23025 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XPAP23025 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XPAP23025 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XPAP23025 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XPAP23025 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XPAP23025 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XPAP23025 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XPAP23025 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XPAP23025 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XPAP23025 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XPAP23025 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XPAP23025 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XPAP23025 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
XPAP23025 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
XPAP23025 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
XPAP23025 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
XPAP23025 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
XPAP23025 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPAP23025 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPAP23025 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPAP23025 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPAP23025 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPAP23025 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPAP23025 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPAP23025 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
XPAP23025 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPAP23025 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPAP23025 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPAP23025 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
XPAP23025 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPAP23025 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPAP23025 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPAP23025 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
XPAP23025 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPAP23025 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPAP23025 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPAP23025 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPAP23025 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XPAP23025 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XPAP23025 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XPAP23025 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XPAP23025 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
XPAP23025 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XPAP23025 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPAP23025 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPAP23025 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPAP23025 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPAP23025 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPAP23025 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPAP23025 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPAP23025 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPAP23025 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPAP23025 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
XPAP23025 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPAP23025 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
XPAP23025 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPAP23025 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
XPAP23025 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPAP23025 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPAP23025 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPAP23025 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPAP23025 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
XPAP23025 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPAP23025 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPAP23025 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPAP23025 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPAP23025 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPAP23025 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPAP23025 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPAP23025 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPAP23025 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms