Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CALB2P22676 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALB2P22676 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALB2P22676 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALB2P22676 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALB2P22676 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALB2P22676 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALB2P22676 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALB2P22676 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CALB2P22676 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CALB2P22676 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALB2P22676 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALB2P22676 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALB2P22676 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALB2P22676 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALB2P22676 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALB2P22676 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALB2P22676 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALB2P22676 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALB2P22676 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALB2P22676 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALB2P22676 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALB2P22676 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALB2P22676 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALB2P22676 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALB2P22676 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALB2P22676 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALB2P22676 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALB2P22676 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALB2P22676 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALB2P22676 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CALB2P22676 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CALB2P22676 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALB2P22676 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALB2P22676 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALB2P22676 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALB2P22676 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALB2P22676 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALB2P22676 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALB2P22676 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALB2P22676 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALB2P22676 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALB2P22676 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CALB2P22676 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CALB2P22676 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALB2P22676 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALB2P22676 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALB2P22676 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALB2P22676 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALB2P22676 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALB2P22676 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALB2P22676 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALB2P22676 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALB2P22676 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CALB2P22676 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALB2P22676 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALB2P22676 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALB2P22676 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALB2P22676 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALB2P22676 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALB2P22676 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALB2P22676 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CALB2P22676 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALB2P22676 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALB2P22676 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALB2P22676 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALB2P22676 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALB2P22676 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALB2P22676 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALB2P22676 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALB2P22676 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALB2P22676 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALB2P22676 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALB2P22676 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALB2P22676 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALB2P22676 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALB2P22676 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALB2P22676 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALB2P22676 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALB2P22676 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALB2P22676 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALB2P22676 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALB2P22676 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALB2P22676 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CALB2P22676 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALB2P22676 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALB2P22676 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALB2P22676 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALB2P22676 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CALB2P22676 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALB2P22676 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALB2P22676 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALB2P22676 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALB2P22676 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALB2P22676 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALB2P22676 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALB2P22676 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALB2P22676 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALB2P22676 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALB2P22676 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms