Protein–RNA interactions for Protein: P22459

KCNA4, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA4P22459 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNA4P22459 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNA4P22459 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNA4P22459 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNA4P22459 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNA4P22459 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNA4P22459 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNA4P22459 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNA4P22459 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNA4P22459 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNA4P22459 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNA4P22459 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNA4P22459 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNA4P22459 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNA4P22459 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNA4P22459 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNA4P22459 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNA4P22459 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNA4P22459 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNA4P22459 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNA4P22459 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNA4P22459 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNA4P22459 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNA4P22459 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNA4P22459 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNA4P22459 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNA4P22459 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNA4P22459 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNA4P22459 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNA4P22459 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNA4P22459 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNA4P22459 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNA4P22459 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KCNA4P22459 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KCNA4P22459 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 AP001442.1-203ENST00000596385 876 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNA4P22459 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCNA4P22459 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCNA4P22459 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCNA4P22459 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNA4P22459 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNA4P22459 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNA4P22459 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNA4P22459 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNA4P22459 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNA4P22459 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNA4P22459 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNA4P22459 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNA4P22459 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNA4P22459 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms