Protein–RNA interactions for Protein: P21108

PRPS1L1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1L1P21108 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPS1L1P21108 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPS1L1P21108 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPS1L1P21108 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPS1L1P21108 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPS1L1P21108 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPS1L1P21108 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPS1L1P21108 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPS1L1P21108 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPS1L1P21108 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPS1L1P21108 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPS1L1P21108 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPS1L1P21108 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms