Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpm3P21107 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpm3P21107 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tpm3P21107 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tpm3P21107 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tpm3P21107 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tpm3P21107 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tpm3P21107 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tpm3P21107 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpm3P21107 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpm3P21107 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpm3P21107 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpm3P21107 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tpm3P21107 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tpm3P21107 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tpm3P21107 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tpm3P21107 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tpm3P21107 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tpm3P21107 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tpm3P21107 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tpm3P21107 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tpm3P21107 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tpm3P21107 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tpm3P21107 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tpm3P21107 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tpm3P21107 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tpm3P21107 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tpm3P21107 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tpm3P21107 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpm3P21107 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpm3P21107 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpm3P21107 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpm3P21107 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm3P21107 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm3P21107 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm3P21107 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm3P21107 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm3P21107 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpm3P21107 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpm3P21107 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpm3P21107 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tpm3P21107 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tpm3P21107 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tpm3P21107 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tpm3P21107 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tpm3P21107 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tpm3P21107 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpm3P21107 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpm3P21107 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpm3P21107 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpm3P21107 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpm3P21107 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpm3P21107 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpm3P21107 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpm3P21107 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpm3P21107 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpm3P21107 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpm3P21107 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpm3P21107 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpm3P21107 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpm3P21107 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpm3P21107 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpm3P21107 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpm3P21107 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpm3P21107 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpm3P21107 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpm3P21107 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms