Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDCP20941 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDCP20941 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDCP20941 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDCP20941 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDCP20941 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDCP20941 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDCP20941 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDCP20941 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDCP20941 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDCP20941 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PDCP20941 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDCP20941 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDCP20941 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDCP20941 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDCP20941 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDCP20941 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDCP20941 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDCP20941 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDCP20941 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PDCP20941 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDCP20941 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDCP20941 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDCP20941 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDCP20941 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDCP20941 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDCP20941 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDCP20941 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDCP20941 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDCP20941 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDCP20941 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDCP20941 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDCP20941 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PDCP20941 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PDCP20941 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PDCP20941 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDCP20941 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDCP20941 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDCP20941 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDCP20941 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDCP20941 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDCP20941 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDCP20941 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDCP20941 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDCP20941 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PDCP20941 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDCP20941 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDCP20941 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDCP20941 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDCP20941 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDCP20941 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDCP20941 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDCP20941 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDCP20941 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PDCP20941 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDCP20941 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDCP20941 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDCP20941 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDCP20941 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDCP20941 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDCP20941 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDCP20941 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDCP20941 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDCP20941 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDCP20941 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDCP20941 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDCP20941 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDCP20941 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDCP20941 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDCP20941 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDCP20941 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDCP20941 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDCP20941 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDCP20941 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDCP20941 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDCP20941 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDCP20941 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDCP20941 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDCP20941 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDCP20941 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDCP20941 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDCP20941 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDCP20941 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PDCP20941 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDCP20941 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDCP20941 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDCP20941 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDCP20941 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDCP20941 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDCP20941 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDCP20941 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDCP20941 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDCP20941 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDCP20941 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDCP20941 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDCP20941 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDCP20941 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDCP20941 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDCP20941 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDCP20941 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms