Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnnc2P20801 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnnc2P20801 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnnc2P20801 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnnc2P20801 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnnc2P20801 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnnc2P20801 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnnc2P20801 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnnc2P20801 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnnc2P20801 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnnc2P20801 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnnc2P20801 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnnc2P20801 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnc2P20801 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnc2P20801 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnc2P20801 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnc2P20801 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnc2P20801 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnc2P20801 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnnc2P20801 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnnc2P20801 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnnc2P20801 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnc2P20801 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnc2P20801 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnnc2P20801 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnnc2P20801 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnnc2P20801 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnnc2P20801 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnnc2P20801 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnnc2P20801 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnnc2P20801 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnnc2P20801 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnnc2P20801 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnc2P20801 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnc2P20801 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnc2P20801 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnc2P20801 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnc2P20801 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnc2P20801 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnc2P20801 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnc2P20801 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnc2P20801 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnc2P20801 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnc2P20801 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnc2P20801 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnc2P20801 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnnc2P20801 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnnc2P20801 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms