Protein–RNA interactions for Protein: P20612

Gnat1, Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnat1P20612 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gnat1P20612 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gnat1P20612 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gnat1P20612 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gnat1P20612 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gnat1P20612 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gnat1P20612 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gnat1P20612 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gnat1P20612 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gnat1P20612 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gnat1P20612 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gnat1P20612 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gnat1P20612 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gnat1P20612 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gnat1P20612 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gnat1P20612 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gnat1P20612 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gnat1P20612 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gnat1P20612 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gnat1P20612 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gnat1P20612 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gnat1P20612 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gnat1P20612 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gnat1P20612 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gnat1P20612 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gnat1P20612 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gnat1P20612 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gnat1P20612 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gnat1P20612 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gnat1P20612 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gnat1P20612 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gnat1P20612 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gnat1P20612 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gnat1P20612 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gnat1P20612 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gnat1P20612 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gnat1P20612 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gnat1P20612 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gnat1P20612 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gnat1P20612 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gnat1P20612 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gnat1P20612 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gnat1P20612 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gnat1P20612 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gnat1P20612 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gnat1P20612 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gnat1P20612 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gnat1P20612 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gnat1P20612 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gnat1P20612 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gnat1P20612 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gnat1P20612 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gnat1P20612 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gnat1P20612 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gnat1P20612 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gnat1P20612 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gnat1P20612 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gnat1P20612 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gnat1P20612 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gnat1P20612 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gnat1P20612 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gnat1P20612 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gnat1P20612 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gnat1P20612 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gnat1P20612 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gnat1P20612 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gnat1P20612 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gnat1P20612 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gnat1P20612 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gnat1P20612 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gnat1P20612 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gnat1P20612 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gnat1P20612 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gnat1P20612 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gnat1P20612 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gnat1P20612 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gnat1P20612 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gnat1P20612 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gnat1P20612 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gnat1P20612 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gnat1P20612 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gnat1P20612 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gnat1P20612 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gnat1P20612 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gnat1P20612 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gnat1P20612 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gnat1P20612 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gnat1P20612 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gnat1P20612 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gnat1P20612 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gnat1P20612 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gnat1P20612 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gnat1P20612 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gnat1P20612 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gnat1P20612 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gnat1P20612 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gnat1P20612 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gnat1P20612 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gnat1P20612 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gnat1P20612 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms