Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NefhP19246 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NefhP19246 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NefhP19246 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NefhP19246 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NefhP19246 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NefhP19246 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NefhP19246 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NefhP19246 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NefhP19246 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NefhP19246 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NefhP19246 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NefhP19246 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NefhP19246 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NefhP19246 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NefhP19246 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NefhP19246 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NefhP19246 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NefhP19246 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NefhP19246 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NefhP19246 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NefhP19246 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NefhP19246 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NefhP19246 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NefhP19246 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NefhP19246 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NefhP19246 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NefhP19246 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NefhP19246 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NefhP19246 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NefhP19246 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NefhP19246 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NefhP19246 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NefhP19246 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NefhP19246 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NefhP19246 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NefhP19246 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NefhP19246 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NefhP19246 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NefhP19246 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NefhP19246 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NefhP19246 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NefhP19246 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NefhP19246 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NefhP19246 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NefhP19246 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NefhP19246 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NefhP19246 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NefhP19246 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NefhP19246 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NefhP19246 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NefhP19246 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NefhP19246 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NefhP19246 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NefhP19246 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NefhP19246 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NefhP19246 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NefhP19246 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NefhP19246 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NefhP19246 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NefhP19246 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NefhP19246 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NefhP19246 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NefhP19246 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NefhP19246 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NefhP19246 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NefhP19246 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NefhP19246 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NefhP19246 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NefhP19246 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NefhP19246 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NefhP19246 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NefhP19246 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NefhP19246 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NefhP19246 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NefhP19246 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NefhP19246 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NefhP19246 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NefhP19246 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NefhP19246 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NefhP19246 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NefhP19246 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NefhP19246 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NefhP19246 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NefhP19246 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NefhP19246 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NefhP19246 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NefhP19246 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
NefhP19246 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NefhP19246 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NefhP19246 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NefhP19246 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NefhP19246 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NefhP19246 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NefhP19246 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NefhP19246 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NefhP19246 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NefhP19246 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NefhP19246 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NefhP19246 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms