Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF1P18846 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF1P18846 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF1P18846 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF1P18846 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF1P18846 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF1P18846 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF1P18846 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF1P18846 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF1P18846 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF1P18846 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF1P18846 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF1P18846 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF1P18846 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF1P18846 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF1P18846 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF1P18846 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF1P18846 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF1P18846 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF1P18846 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF1P18846 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF1P18846 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF1P18846 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF1P18846 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF1P18846 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATF1P18846 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF1P18846 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF1P18846 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF1P18846 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF1P18846 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF1P18846 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF1P18846 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF1P18846 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF1P18846 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF1P18846 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF1P18846 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF1P18846 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF1P18846 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF1P18846 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF1P18846 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF1P18846 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF1P18846 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF1P18846 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF1P18846 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF1P18846 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF1P18846 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF1P18846 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF1P18846 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF1P18846 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF1P18846 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF1P18846 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF1P18846 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF1P18846 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF1P18846 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF1P18846 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF1P18846 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF1P18846 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF1P18846 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF1P18846 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF1P18846 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF1P18846 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF1P18846 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF1P18846 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF1P18846 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF1P18846 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF1P18846 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF1P18846 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF1P18846 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF1P18846 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATF1P18846 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF1P18846 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATF1P18846 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF1P18846 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF1P18846 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATF1P18846 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATF1P18846 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATF1P18846 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATF1P18846 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATF1P18846 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATF1P18846 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATF1P18846 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATF1P18846 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATF1P18846 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATF1P18846 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATF1P18846 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATF1P18846 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATF1P18846 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATF1P18846 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATF1P18846 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATF1P18846 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATF1P18846 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATF1P18846 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATF1P18846 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATF1P18846 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATF1P18846 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATF1P18846 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATF1P18846 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATF1P18846 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATF1P18846 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATF1P18846 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms