Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rps6ka3P18654 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rps6ka3P18654 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps6ka3P18654 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps6ka3P18654 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps6ka3P18654 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps6ka3P18654 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps6ka3P18654 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps6ka3P18654 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps6ka3P18654 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rps6ka3P18654 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rps6ka3P18654 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rps6ka3P18654 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rps6ka3P18654 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rps6ka3P18654 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rps6ka3P18654 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rps6ka3P18654 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps6ka3P18654 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps6ka3P18654 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps6ka3P18654 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps6ka3P18654 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps6ka3P18654 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rps6ka3P18654 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rps6ka3P18654 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps6ka3P18654 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rps6ka3P18654 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rps6ka3P18654 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rps6ka3P18654 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka3P18654 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka3P18654 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka3P18654 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka3P18654 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka3P18654 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka3P18654 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka3P18654 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka3P18654 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka3P18654 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka3P18654 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka3P18654 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka3P18654 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps6ka3P18654 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps6ka3P18654 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps6ka3P18654 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps6ka3P18654 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka3P18654 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka3P18654 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka3P18654 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka3P18654 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka3P18654 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps6ka3P18654 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps6ka3P18654 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps6ka3P18654 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps6ka3P18654 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rps6ka3P18654 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rps6ka3P18654 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rps6ka3P18654 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms