Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NELFEP18615 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NELFEP18615 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NELFEP18615 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NELFEP18615 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NELFEP18615 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NELFEP18615 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NELFEP18615 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NELFEP18615 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NELFEP18615 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELFEP18615 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELFEP18615 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELFEP18615 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELFEP18615 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELFEP18615 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NELFEP18615 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELFEP18615 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELFEP18615 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELFEP18615 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NELFEP18615 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NELFEP18615 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NELFEP18615 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NELFEP18615 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NELFEP18615 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NELFEP18615 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NELFEP18615 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NELFEP18615 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NELFEP18615 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NELFEP18615 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NELFEP18615 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NELFEP18615 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NELFEP18615 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NELFEP18615 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NELFEP18615 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NELFEP18615 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NELFEP18615 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NELFEP18615 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NELFEP18615 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NELFEP18615 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NELFEP18615 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NELFEP18615 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NELFEP18615 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NELFEP18615 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NELFEP18615 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NELFEP18615 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NELFEP18615 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NELFEP18615 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NELFEP18615 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NELFEP18615 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NELFEP18615 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NELFEP18615 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NELFEP18615 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NELFEP18615 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NELFEP18615 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NELFEP18615 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NELFEP18615 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NELFEP18615 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NELFEP18615 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NELFEP18615 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NELFEP18615 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NELFEP18615 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NELFEP18615 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NELFEP18615 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NELFEP18615 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NELFEP18615 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NELFEP18615 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NELFEP18615 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NELFEP18615 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NELFEP18615 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NELFEP18615 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NELFEP18615 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NELFEP18615 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NELFEP18615 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NELFEP18615 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NELFEP18615 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NELFEP18615 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NELFEP18615 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NELFEP18615 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NELFEP18615 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NELFEP18615 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NELFEP18615 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NELFEP18615 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NELFEP18615 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NELFEP18615 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NELFEP18615 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NELFEP18615 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NELFEP18615 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NELFEP18615 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NELFEP18615 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NELFEP18615 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NELFEP18615 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NELFEP18615 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NELFEP18615 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NELFEP18615 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NELFEP18615 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NELFEP18615 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NELFEP18615 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NELFEP18615 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NELFEP18615 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NELFEP18615 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms