Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCP1P17987 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCP1P17987 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCP1P17987 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TCP1P17987 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TCP1P17987 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCP1P17987 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCP1P17987 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCP1P17987 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCP1P17987 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCP1P17987 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCP1P17987 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCP1P17987 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCP1P17987 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCP1P17987 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
TCP1P17987 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCP1P17987 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCP1P17987 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCP1P17987 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCP1P17987 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCP1P17987 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCP1P17987 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCP1P17987 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCP1P17987 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCP1P17987 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCP1P17987 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCP1P17987 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCP1P17987 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCP1P17987 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCP1P17987 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCP1P17987 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCP1P17987 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCP1P17987 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCP1P17987 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCP1P17987 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCP1P17987 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCP1P17987 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCP1P17987 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCP1P17987 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCP1P17987 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCP1P17987 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCP1P17987 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCP1P17987 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCP1P17987 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TCP1P17987 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCP1P17987 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCP1P17987 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCP1P17987 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCP1P17987 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCP1P17987 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCP1P17987 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCP1P17987 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TCP1P17987 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCP1P17987 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCP1P17987 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCP1P17987 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCP1P17987 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCP1P17987 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCP1P17987 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCP1P17987 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCP1P17987 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCP1P17987 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCP1P17987 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TCP1P17987 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCP1P17987 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCP1P17987 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCP1P17987 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCP1P17987 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCP1P17987 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCP1P17987 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCP1P17987 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCP1P17987 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TCP1P17987 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TCP1P17987 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TCP1P17987 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCP1P17987 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCP1P17987 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCP1P17987 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCP1P17987 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCP1P17987 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCP1P17987 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCP1P17987 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCP1P17987 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TCP1P17987 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCP1P17987 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCP1P17987 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TCP1P17987 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCP1P17987 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCP1P17987 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCP1P17987 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCP1P17987 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCP1P17987 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCP1P17987 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCP1P17987 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCP1P17987 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCP1P17987 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCP1P17987 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCP1P17987 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCP1P17987 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCP1P17987 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms