Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spi1P17433 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spi1P17433 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spi1P17433 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spi1P17433 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spi1P17433 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spi1P17433 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spi1P17433 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spi1P17433 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spi1P17433 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spi1P17433 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spi1P17433 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spi1P17433 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spi1P17433 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spi1P17433 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spi1P17433 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spi1P17433 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spi1P17433 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spi1P17433 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spi1P17433 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spi1P17433 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spi1P17433 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spi1P17433 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spi1P17433 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spi1P17433 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spi1P17433 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spi1P17433 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Spi1P17433 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Spi1P17433 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spi1P17433 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spi1P17433 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spi1P17433 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spi1P17433 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spi1P17433 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spi1P17433 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spi1P17433 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spi1P17433 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spi1P17433 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spi1P17433 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spi1P17433 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spi1P17433 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Spi1P17433 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spi1P17433 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spi1P17433 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spi1P17433 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spi1P17433 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spi1P17433 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms