Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptbp1P17225 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptbp1P17225 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptbp1P17225 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptbp1P17225 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptbp1P17225 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ptbp1P17225 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ptbp1P17225 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptbp1P17225 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptbp1P17225 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms