Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmga1P17095 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmga1P17095 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmga1P17095 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmga1P17095 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmga1P17095 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmga1P17095 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmga1P17095 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmga1P17095 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmga1P17095 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmga1P17095 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmga1P17095 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmga1P17095 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmga1P17095 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmga1P17095 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmga1P17095 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmga1P17095 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmga1P17095 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Hmga1P17095 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hmga1P17095 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hmga1P17095 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmga1P17095 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmga1P17095 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmga1P17095 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmga1P17095 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmga1P17095 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmga1P17095 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmga1P17095 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmga1P17095 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmga1P17095 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmga1P17095 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmga1P17095 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmga1P17095 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmga1P17095 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmga1P17095 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmga1P17095 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmga1P17095 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmga1P17095 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmga1P17095 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmga1P17095 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmga1P17095 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmga1P17095 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmga1P17095 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmga1P17095 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmga1P17095 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmga1P17095 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmga1P17095 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmga1P17095 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmga1P17095 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hmga1P17095 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmga1P17095 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmga1P17095 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmga1P17095 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmga1P17095 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmga1P17095 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmga1P17095 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmga1P17095 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmga1P17095 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmga1P17095 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmga1P17095 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmga1P17095 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmga1P17095 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.1 ms